Ancêtre mystérieux accouplé avec des humains anciens. Et son ADN «imbriqué» vient d'être trouvé.

  • Yurii Mongol
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Les humains d'aujourd'hui portent les gènes d'un ancien ancêtre inconnu, laissé par des espèces d'hominidés se mélangeant il y a peut-être un million d'années.. 

L'ancêtre peut avoir été l'homo erectus, mais personne ne sait avec certitude - le génome de cette espèce humaine éteinte n'a jamais été séquencé, a déclaré Adam Siepel, biologiste informatique au Cold Spring Harbor Laboratory et l'un des auteurs d'un nouvel article examinant les relations d'anciens ancêtres humains.. 

La nouvelle recherche, publiée aujourd'hui (6 août) dans la revue PLOS Genetics, révèle également que d'anciens humains se sont accouplés avec des Néandertaliens il y a entre 200000 et 300000 ans, bien avant le mélange plus récent et mieux connu des deux espèces, après Homo sapiens migré en grand nombre hors d'Afrique et en Europe il y a 50 000 ans. Grâce à cet ancien événement de mélange, les Néandertaliens doivent en fait entre 3% et 7% de leurs génomes à d'anciens Homo sapiens, les chercheurs ont rapporté. 

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"Notre meilleure conjecture est qu'un premier groupe d'humains anatomiquement modernes a quitté l'Afrique pour se retrouver et se croiser avec des Néandertaliens, peut-être au Moyen-Orient", a déclaré Siepel. "Cette lignée [des humains] aurait alors été perdue - soit disparue, soit absorbée par les Néandertaliens, soit migrée vers l'Afrique." 

Mélangeurs anciens

La nouvelle recherche illustre la complexité de l'histoire profonde de l'humanité. Des preuves s'accumulent depuis longtemps que les humains et les Néandertaliens se sont accouplés alors que leurs populations se chevauchaient en Europe, avant que les Néandertaliens ne disparaissent il y a environ 30000 ans. En 2010, les chercheurs ont rapporté qu'entre 1% et 4% des gènes humains modernes chez les personnes en Asie, en Europe et en Océanie provenaient d'ancêtres néandertaliens. Lorsque vous additionnez tous les extraits d'ADN de Néandertal présent chez tous les humains modernes aujourd'hui, environ 20% du génome de Néandertal pourrait être préservé, selon une étude de 2014.

Alors que les scientifiques ont pu séquencer des fragments d'ADN plus fragiles à partir de fossiles d'anciens ancêtres humains, ils ont découvert un réseau complexe de métissage remontant à des millénaires. Certains insulaires du Pacifique, par exemple, portent des morceaux de l'ADN d'une mystérieuse espèce humaine ancienne connue sous le nom de Denisovans.. 

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Les chercheurs de la nouvelle étude ont utilisé une méthode de calcul pour comparer les génomes de deux Néandertaliens, un Denisovan et deux individus africains modernes. (Les Africains ont été choisis parce que les Africains modernes ne portent pas les gènes néandertaliens du métissage humain-néandertalien bien connu qui a eu lieu en Europe il y a 50000 ans.) Cette méthode a permis aux chercheurs de capturer des événements de recombinaison, dans lesquels des segments de chromosomes - qui sont constitués d'ADN - d'un individu est incorporé dans les chromosomes d'un autre. 

"Nous essayons de construire un modèle complet pour l'histoire évolutive de chaque segment du génome, conjointement à travers tous les individus analysés", a déclaré Siepel. "Le graphe de recombinaison ancestrale, comme on l'appelle, comprend un arbre qui capture les relations entre tous les individus à chaque position le long du génome, et les événements de recombinaison qui font changer ces arbres d'une position à l'autre."

L'un des avantages de la méthode, a déclaré Siepel, est qu'elle permet aux chercheurs de trouver des événements de recombinaison à l'intérieur d'événements de recombinaison. Par exemple, si un peu d'ADN d'hominine ancien d'un ancêtre inconnu était incorporé dans le génome de Néandertal, puis qu'un événement d'accouplement ultérieur entre les Néandertaliens et les humains a inséré cet ADN mystère dans le génome humain, la méthode permet l'identification de ce "nidifié" "ADN. 

Histoire complexe

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L'analyse a révélé des preuves de ce type d'insertion imbriquée d'ADN. La découverte que Homo sapiens semblent s'être accouplés avec les Néandertaliens il y a entre 200000 et 300000 ans des mailles avec des preuves antérieures d'une sorte d'événement de mélange entre les deux espèces avant que les humains ne se déplacent en masse vers l'Europe, a déclaré Siepel. 

Les chercheurs ont également découvert que 1% du génome de Denisovan provient des gènes d'un ancêtre inconnu, d'un événement de métissage qui doit avoir eu lieu, il y a environ un million d'années. Cet ancêtre mystérieux aurait pu être l'homo erectus, Siepel a dit, parce que l'homo erectus probablement chevauchaient en Eurasie avec les ancêtres des Denisovans et des Néandertaliens. Cependant, ces fragments sont minuscules et il n'y a pas l'homo erectus séquences auxquelles les comparer, c'est donc spéculatif. 

Dans les deux cas, ces événements de métissage ont été à nouveau transmis aux humains modernes: 15% des séquences de métissage trouvées chez les Denisoviens sont présentes chez des personnes vivant aujourd'hui, ont constaté les chercheurs.. 

Les nouveaux résultats sont une autre preuve que les lignées humaines anciennes et modernes se mélangent relativement fréquemment, a déclaré Siepel.. 

"Une image émerge d'une série de populations distinctes mais liées se déplaçant dans le monde entier et interagissant fréquemment les unes avec les autres, avec des événements de croisement occasionnels qui ont produit une progéniture hybride", a déclaré Siepel. "Ces descendants hybrides pourraient dans certains cas avoir souffert d'une condition physique réduite - c'est un sujet de controverse - mais apparemment beaucoup d'entre eux étaient en assez bonne santé pour survivre et se reproduire, laissant un patchwork d'ADN humain archaïque et moderne chez les Néandertaliens, les Denisoviens et les humains modernes. . "

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