J'ai passé 9 tests ADN commerciaux différents et j'ai obtenu 6 résultats différents

  • Vlad Krasen
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Le truc chez moi, c'est que je suis juif. Ce n'est pas la seule chose à propos de moi. Je mesure aussi 5 pieds 11 pouces, porte des lunettes et adore le vélo. Mais la plupart des gens qui me connaissent ne seraient probablement pas surpris d'apprendre que la plupart de mes ancêtres vivaient dans des shtetls en Europe de l'Est.

Donc, ce n'était pas trop surprenant quand j'ai envoyé neuf échantillons d'ADN à trois sociétés d'ADN différentes sous une variété de faux noms, et les résultats ont indiqué que je suis juif ashkénaze super-duper. (Les Ashkénazes sont des Juifs dont l'ascendance remonte aux populations de langue yiddish habitant la région entre la France et la Russie.)

Voici ce qui était un peu surprenant, cependant: aucune des sociétés - AncestryDNA, 23andMe et National Geographic, qui travaille avec une société de test appelée Helix - n'a pu s'entendre sur la façon dont je suis ashkénaze. [Comment fonctionnent réellement les tests d'ascendance ADN?]

Trois entreprises, trois erreurs et six résultats différents

AncestryDNA

AncestryDNA a examiné le premier échantillon d'ADN qui m'a été envoyé et a rapporté que je suis à 93% «juif européen». Le reste de mon ascendance, suggéra-t-il, est le suivant: 2 pour cent remontent à la péninsule ibérique (c'est-à-dire l'Espagne et le Portugal); 1 pour cent remonte au "Sud européen"; 1 pour cent remonte au Moyen-Orient; et le reste vient d'ailleurs.

(Crédit d'image: Ancestry)

Le deuxième échantillon a produit des résultats similaires - quoique curieusement non identiques. Ce morceau de Rafi-spit-in-a-tube, a-t-il rapporté, était à seulement 92% ashkénaze, mais à 3% ibérique. Le reste de l'ADN, selon Ancestry, pourrait remonter au Moyen-Orient et au sud de l'Europe ou dans d'autres régions. Mais chacune de ces sources représentait, au plus, moins de 1% de mon ADN, selon le site.

(Crédit d'image: Ancestry)

(a envoyé un troisième échantillon de mon ADN à Ancestry sous un troisième nom, mais une erreur nous empêche d'accéder aux résultats.)

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23andMe

Comme AncestryDNA, 23andMe a conclu à partir du premier échantillon d'ADN que mon Ashkenaziness se situe quelque part dans les années 90, avec un peu de différence entre chacun des échantillons reçus. Contrairement à AncestryDNA, il avait une interprétation pas entièrement ancienne de l'origine de mes ancêtres - suggérant qu'une fraction de 1% de mes ancêtres étaient peut-être amérindiens. (Compte tenu de ce que je sais de mon histoire familiale, ce n'est certainement pas vrai.)

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Cependant, pendant que je rapportais cette histoire, 23andMe a mis à jour son système d'interprétation des échantillons d'ADN et réévalué tout l'ADN déjà dans son système. Maintenant, lorsque je me connecte à 23andMe en utilisant les trois noms différents que j'ai donnés, les rapports pour deux de ces noms indiquent que j'ai 100% d'ascendance ashkénaze. [Les meilleurs kits de test ADN de 2018]

(Un troisième échantillon envoyé à 23andMe n'a renvoyé aucun résultat. A attribué le nom d'une femme à l'un des échantillons qu'elle a envoyés à chaque entreprise et a marqué son sexe comme étant une femme. AncestryDNA a très bien traité son échantillon "féminin", sans aucune indication d'inattendu , mais 23andMe et Nat Geo avaient besoin de plus d'informations personnelles avant de continuer, car elles provenaient d'une personne avec des chromosomes inattendus.)

(Crédit d'image: 23andMe)

Nat Geo et Helix

Enfin, il y a Nat Geo, qui utilise un service appelé Helix pour faire ses tests ADN. Helix gère le traitement de l'ADN brut, tandis que Nat Geo s'occupe de l'interprétation.

Selon Nat Geo, je suis beaucoup moins ashkénaze à 100%. Le service génétique a rapporté que l'ascendance de mon premier échantillon était à 88% de la «diaspora juive» (dans ce contexte, un terme qui fait plus ou moins référence aux ashkénazes) et à 10% de «l'Italie et l'Europe du Sud».

(Crédit d'image: Nat Geo)

Nat Geo a également signalé la plus grande différence entre ses deux échantillons réussis, indiquant que le deuxième échantillon qu'il a reçu était de 3 pour cent moins de «diaspora juive» que le premier - seulement 85 pour cent. Le reste, cette fois, était de 13% «Italie et Europe du Sud».

(Crédit d'image: Nat Geo)

Donc, neuf tests ADN plus tard, j'ai appris ceci sur moi-même: je suis beaucoup juif ashkénaze. Comme, surtout. Ou entièrement. Le reste de mes ancêtres de mémoire récente vivait probablement aussi en Europe - mais qui sait vraiment où. Et peut-être que quelque part dans mon arbre généalogique, il y avait un Moyen-Orient ou un Amérindien. Mais probablement (presque certainement) non.

Mais, bien sûr, je savais déjà tout ça.

La science

Les scientifiques spécialisés dans ce type de recherche ont déclaré que rien de tout cela n'est si surprenant, bien qu'ils aient noté que le fait que les entreprises ne puissent même pas produire des résultats cohérents à partir d'échantillons prélevés sur la même personne était un peu étrange..

«L'ascendance en elle-même est une chose amusante, en ce sens que les humains n'ont jamais été ces groupes distincts de personnes», a déclaré Alexander Platt, un expert en génétique des populations à l'Université Temple de Philadelphie. "Donc, vous ne pouvez pas vraiment dire que quelqu'un descend à 92,6% de ce groupe de personnes alors que ce n'est pas vraiment une chose."

Connectez-vous à un site Web comme celui de Nat Geo et il divise le monde en différents morceaux. Certains de vos ancêtres venaient de cet endroit, dit-il, et ils étaient d'Asie centrale. D'autres venaient de cet endroit là-bas, et ils étaient du Moyen-Orient. Mais ce n'est pas à quoi ressemble l'histoire humaine. Les populations s'affairent ensemble. Les gens se déplacent, se rassemblent et se séparent. Une personne qui se dit italienne aujourd'hui se serait peut-être qualifiée de Gauloise il y a quelques milliers d'années et serait partie en guerre contre les Romains..

Pour diviser les gens en groupes, a déclaré Platt, les chercheurs prennent des décisions: par exemple, diront-ils, les membres de ce groupe de personnes vivent tous au Maroc depuis au moins plusieurs générations, nous ajouterons donc leur ADN aux bibliothèques de référence. pour les marocains. Et les gens qui avaient un grand-parent avec ce type d'ADN entendront dire qu'ils sont à 25% marocains. Mais cette frontière, dit Platt, est fondamentalement «imaginaire».

"Il y a une structure dans l'histoire", a-t-il dit. "Certains peuples sont plus étroitement liés les uns aux autres qu'aux autres peuples. Et [les sociétés commerciales d'ADN] essaient de créer des frontières au sein de ces clusters. Mais ces frontières n'ont jamais vraiment existé, et ce ne sont pas des choses réelles."

Dans certains endroits, c'est plus facile. Les populations européennes non juives, a-t-il déclaré, avaient tendance à ne pas se mélanger autant avec les autres que les autres dans le monde, de sorte que les entreprises peuvent facilement faire des distinctions plus fines entre elles..

Mais au final, cela ne veut rien dire d'être à 35% irlandais ou à 76% finlandais. Ainsi, lorsque 23andMe a changé d'avis sur mon ascendance, la réponse à 100% n'était pas plus vraie. C'était juste une autre façon d'interpréter les données.

(Dans ce cas, a déclaré Platt, la société a probablement décidé que puisque presque tous les juifs ashkénazes ont des gènes en commun avec un mélange d'autres populations européennes, il est logique d'appeler ces gènes également ashkénazes.)

«Ce n'est pas vraiment de la science mais plutôt de la description», a-t-il déclaré. "Il n'y a pas vraiment de bonne ou de mauvaise réponse ici, car il n'y a pas de désignation officielle de ce que signifie génétiquement être juif ashkénaze."

Ce n'est pas vraiment étrange pour lui qu'il y ait un écart de 15% de judéité entre mes résultats dans Nat Geo et dans 23andMe, a-t-il déclaré..

(Crédit d'image: Rafi Letzter /)

Mark Stoneking, un généticien des populations et chef de groupe à l'Institut Max Planck d'anthropologie évolutive de Leipzig, en Allemagne, est d'accord.

"S'ils devaient être tout à fait honnêtes, ce qu'ils devraient vous dire, ce n'est pas que vous êtes italien à 47%, mais que vous avez 47 ans plus ou moins une marge d'erreur… en fonction de leur capacité à distinguer cette ascendance et d'autres sources d'erreur qui entrer dans l'estimation », a déclaré Stoneking .

Et il est clair qu'il existe des sources d'erreur, a-t-il déclaré. Ni Stoneking ni Platt ne savaient exactement pourquoi AncestryDNA avait une différence de 1% entre ses résultats pour différents échantillons, ou Nat Geo avait une différence de 3%, ou 23andMe avait une marge de manœuvre qui a disparu avec la mise à jour. Mais ils ont convenu que cela avait probablement quelque chose à voir avec leurs méthodes de conversion d'un flacon de broche en données pour que l'ordinateur les interprète. (a demandé aux trois sociétés d'expliquer le problème, mais aucune n'a donné de réponse précise.) [Génétique: l'étude de l'hérédité]

Chacune de ces sociétés, a déclaré Stoneking, décompose l'ADN de l'échantillon de broche en allèles - des marqueurs génétiques qu'elles utilisent comme données brutes. Mais ce processus est imparfait et ne fonctionne clairement pas de la même manière à chaque fois que les entreprises gèrent le reste, a-t-il déclaré - bien que les erreurs ne soient pas extrêmement importantes..

Devriez-vous faire tester votre ADN?

Rien de tout cela ne signifie qu'un kit d'ascendance de 23andMe ou d'AncestryDNA ou de Nat Geo est sans valeur, ont convenu Stoneking et Platt.

"Je considère ces choses plus comme un divertissement qu'autre chose", a déclaré Stoneking.

La vraie science de la génétique des populations, a-t-il expliqué, est utilisée pour déterminer comment de grands groupes de personnes se déplacent et se mélangent au fil du temps. Et c'est bon pour cela. Mais déterminer si 3 à 13% de mes ancêtres venaient de la péninsule ibérique ou d'Italie ne fait pas partie de ce projet.

Platt a déclaré qu'il s'était fait tester commercialement et que même s'il n'avait rien trouvé de surprenant, il est toujours possible pour quelqu'un d'apprendre quelque chose de nouveau et d'intéressant - en particulier s'il est d'origine européenne non juive et vague sur les détails. Un non-juif blanc peut apprendre quelque chose de spécifique et d'intéressant sur son parcours, car ses ancêtres proviennent probablement de populations de référence très isolées sur lesquelles les entreprises disposent de nombreuses données. Mais les gens d'autres endroits ont des cotes plus faibles, simplement parce que les données d'autres endroits sont plus limitées, floues et difficiles à interpréter.

Lorsque j'ai contacté les entreprises et leur ai demandé de commenter cette histoire et de répondre à la question de savoir pourquoi mes résultats pouvaient différer - même lorsque le test a été effectué par la même entreprise - Ancestry et 23andMe ont répondu.

Voici ce que Ancestry a dit:

«Nous sommes confiants dans la science et les résultats que nous donnons aux clients. L'industrie de la génomique grand public en est à ses débuts mais connaît une croissance rapide et nous disons aux clients tout au long de l'expérience que leurs résultats sont aussi précis que possible pour ce qui est de la science. aujourd'hui, et qu'elle peut évoluer au fil du temps à mesure que la résolution des estimations ADN s'améliore. Nous travaillerons toujours pour exploiter les évolutions scientifiques pour améliorer l'expérience de nos clients. Par exemple, les développements récents de la science de l'ADN nous ont permis de développer un nouveau algorithme qui détermine la répartition ethnique des clients avec un degré de précision plus élevé. "

Et voici le commentaire de 23andMe, que le représentant a demandé d'attribuer à Robin Smith, un Ph.D. qui détient le titre de chef de projet groupe au sein de l'entreprise:

«Nos rapports d'ascendance sont une analyse vivante et sont en constante évolution. À mesure que notre base de données se développera, nous serons en mesure de fournir aux clients des informations plus granulaires sur leur ascendance et leur appartenance ethnique. Nous améliorons constamment nos ensembles de données de référence et l'ensemble pipeline que nous utilisons pour calculer les rapports de composition d'ascendance des clients. En fait, nous avons récemment déployé une mise à jour complète de l'ascendance plus tôt dans l'année, augmentant ainsi le nombre de pays et de régions sur lesquels nous faisons rapport, afin de fournir des informations plus détaillées aux populations sous-représentées dans l'étude de la génétique.

"En ce qui concerne les populations de référence ashkénazes, notre précision pour appeler l'ascendance AJ [juive ashkénaze], s'est en effet améliorée de 97 pour cent à 99 pour cent au cours des deux dernières années pour ces raisons. Notre rappel, ce qui signifie toute l'ascendance juive ashkénaze dans le ensemble de données, combien appelons-nous AJ s'est amélioré à 97%, contre 93% il y a deux ans.

"Il peut y avoir des incohérences entre les tests d'ascendance ADN en raison de différents algorithmes et panels de référence qui diffèrent sur des points clés."

Nat Geo n'a pas répondu à plusieurs demandes de commentaires au moment de la presse.




04.03.24 18:43
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